4 мая 2018 года в Научно-технологическом парке биомедицины Сеченовского университета с лекцией «Биоинформатика для секвенирования нового поколения – области применения и вызовы» выступил профессор факультета информатики Университета штата Джорджия (США) Алекс Зеликовский (Alex Zelikovsky).

Цель – представить студентам Сеченовского университета, обучающимся по специальностям «Биоинженерия и биоинформатика», «Биотехнология» направления научного поиска в сфере NGS (Next Generations Sequencing) – секвенировании следующего поколения – непосредственной расшифровки генетической информации.

NGS – высокочувствительное исследование, которое с высокой долей вероятности – 99,999% (оценка качества Q50 по Phred Quality Score) позволяет выявить генетические изменения и обеспечивает доступ к огромному количеству данных. В частности этот метод позволяет подтвердить диагноз, оценить состояние здоровья пациента и подобрать терапию с учетом его индивидуальных особенностей. Еще одна область применения NGS, наряду со многими другими, – изучение распространения вирусных инфекций, вирусное гаплотипирование. Информация, полученная с помощью секвенирования, позволяет исследователям выявлять изменения в генах, ассоциациях с болезнями и фенотипами и определять потенциальные целевые объекты.

Профессор Зеликовский привел примеры использования данных NGS и представил разработанные в лаборатории Университете штата Джорджия (входит в топ-400 университетов мира согласно рейтингу THE) инструменты для анализа геномных данных.

Лаборатория биоинформатики Института молекулярной медицины Сеченовского университета (руководитель лаборатории Юрий Порозов) совместно с учеными Университета штата Джорджия работает над новыми методами гаплотипирования вирусов. Научные результаты будут опубликованы в самое ближайшее время.