A coarse-grained model for DNA origami
|
|
Головин Андрей Викторович (ведущий научный сотрудник Лаборатория молекулярной биологии и биохимии)
|
Nucleic Acids Research |
|
|
Modeling tools provide a valuable support for DNA origami design. However, current solutions have limited application for conformational analysis of the designs. In this work we present a tool for a thorough study of DNA origami structure and dynamics. The tool is based on a novel coarse-grained model dedicated to geometry optimization and conformational analysis of DNA origami. We explored the ability of the model to predict dynamic behavior, global shapes, and fine details of two single-layer systems designed in hexagonal and square lattices using atomic force microscopy, Förster resonance energy transfer spectroscopy, and all-atom molecular dynamic simulations for validation of the results. We also examined the performance of the model for multilayer systems by simulation of DNA origami with published cryo-electron microscopy and atomic force microscopy structures. A good agreement between the simulated and experimental data makes the model suitable for conformational analysis of DNA origami objects. The tool is available at http://vsb.fbb.msu.ru/cosm as a web-service and as a standalone version.
Читать
тезис
Публикация |
Mechanical stress-induced subcellular re-localization of N-terminally truncated tobacco Nt-4/1 protein
|
|
Соловьев Андрей Геннадьевич (ведущий научный сотрудник Лаборатория молекулярной биологии и биохимии)
|
BIOCHIMIE |
|
|
The Nicotiana tabacum 4/1 protein (Nt-4/1) of unknown function expressed in plant vasculature has been shown to localize to cytoplasmic bodies associated with endoplasmic reticulum. Here, we analyzed molecular interactions of an Nt-4/1 mutant with a deletion of 90 N-terminal amino acid residues (Nt-4/1d90) having a diffuse GFP-like localization. Upon transient co-expression with VAP27, a membrane protein known to localize to the ER, ER-plasma membrane contact sites and plasmodesmata, Nt-4/1d90 was concentrated around the cortical ER tubules, forming a network matching the shape of the cortical ER. Additionally, in response to mechanical stress, Nt-4/1d90 was re-localized to small spherical bodies, whereas the subcellular localization of VAP27 remained essentially unaffected. The Nt-4/1d90-containing bodies associated with microtubules, which underwent noticeable bundling under the conditions of mechanical stress. The Nt-4/1d90 re-localization to spherical bodies could also be induced by incubation at an elevated temperature, although under heat shock conditions the re-localization was less efficient and incomplete. An Nt-4/1d90 mutant, which had phosphorylation-mimicking mutations in a predicted cluster of four potentially phosphorylated residues, was found to both inefficiently re-localize to spherical bodies and tend to revert back to the initial diffuse localization. The presented data show that Nt-4/1 has a potential for response to stresses that is manifested by its deletion mutant Nt-4/1d90, and this response can be mediated by protein dephosphorylation.
Читать
тезис
Публикация |
A new tridecapeptide with an actaarginine vector has analgesic therapeutic potential and prevents morphine-induced tolerance
|
|
Порозов Юрий Борисович (Заведующий лабораторией биоинформатики, Доцент)
Гуреев Максим Александрович (Младший научный сотрудник)
|
Peptides |
|
|
2 был модифицирован включением вектора (d-Arg) 8 для предотвращения действия эндопептидазы и увеличения продолжительности обезболивающего действия тетрапептида при пероральном введении , Целью данного исследования было оценить анальгетическую эффективность тетрапептида с (d-Arg) 8(тридекапептид, TDP) в экспериментальных моделях острой и хронической боли. Анальгезирующие эффекты TDP оценивали с использованием модели острой висцеральной боли у мышей (тест на корч) и модели хронической невропатической боли (хроническое сужающее повреждение (CCI) седалищного нерва) у крыс. Внутривенное введение морфина (0,32-1 мг / кг) и TDP (0,32-1,8 мг / кг) приводило к значительным антиноцицептивным эффектам, связанным с дозой, в тесте на корч. Активность TDP после введения ig была ниже, чем после внутривенного введения, но сравнима с таковой ig морфина. В модели CCI TDP (0,1, 1 и 10 мг / кг, мкг) вызывал выраженную анальгезию при повторном введении без каких-либо признаков толерантности. Однократное введение TDP после лечения морфином (7 дней) вызывало значительный обезболивающий эффект у морфин-толерантных крыс, что указывает на отсутствие перекрестной переносимости между этими двумя препаратами. Комбинированное введение TDP и морфина привело к снижению анальгетической толерантности к морфию. Отсутствие перекрестной толерантности к морфию и способность предотвращать морфиновую толерантность позволяет этому соединению быть потенциальным кандидатом для лечения хронической боли. Чтобы найти рецепторы-мишени для TDP, было проведено исследование стыковки. Было обнаружено, что молекула может связываться с рецептором NMDA с помощью электростатических, водородных связей и гидрофобных взаимодействий. Отсутствие перекрестной толерантности к морфию и способность предотвращать морфиновую толерантность позволяет этому соединению быть потенциальным кандидатом для лечения хронической боли. Чтобы найти рецепторы-мишени для TDP, было проведено исследование стыковки. Было обнаружено, что молекула может связываться с рецептором NMDA с помощью электростатических, водородных связей и гидрофобных взаимодействий. Отсутствие перекрестной толерантности к морфию и способность предотвращать морфиновую толерантность позволяет этому соединению быть потенциальным кандидатом для лечения хронической боли. Чтобы найти рецепторы-мишени для TDP, было проведено исследование стыковки. Было обнаружено, что молекула может связываться с рецептором NMDA с помощью электростатических, водородных связей и гидрофобных взаимодействий.
Читать
тезис
Публикация |
Pro-neurogenic, Memory-Enhancing and Anti-stress Effects of DF302, a Novel Fluorine Gamma-Carboline Derivative with Multi-target Mechanism of Action
|
|
Петер Леш (руководитель лаборатории Психиатрической Нейробиологии)
Стрекалова Т.В. ( зам руководителя лаборатории Психиатрической Нейробиологии)
Умрюхин А.T. (старший научный сотрудник)
Баженова Н.С. (младший научный сотрудник)
|
Molecular Neurobiology |
|
|
A comparative study performed in mice investigating the action of DF302, a novel fluoride-containing gamma-carboline derivative, in comparison to the structurally similar neuroprotective drug dimebon. Drug effects on learning and memory, emotionality, hippocampal neurogenesis and mitochondrial functions, as well as AMPA-mediated currents and the 5-HT6 receptor are reported. In the step-down avoidance and fear-conditioning paradigms, bolus administration of drugs at doses of 10 or 40 mg/kg showed that only the higher dose of DF302 improved long-term memory while dimebon was ineffective at either dosage. Short-term memory and fear extinction remained unaltered across treatment groups. During the 5-day predation stress paradigm, oral drug treatment over a period of 2 weeks at the higher dosage regimen decreased anxiety-like behaviour. Both compounds supressed inter-male aggression in CD1 mice, the most eminent being the effects of DF302 in its highest dose. DF302 at the higher dose decreased floating behaviour in a 2-day swim test and after 21-day ultrasound stress. The density of Ki67-positive cells, a marker of adult neurogenesis, was reduced in the dentate gyrus of stressed dimebon-treated and non-treated mice, but not in DF302-treated mice. Non-stressed mice that received DF302 had a higher density of Ki67-positive cells than controls unlike dimebon-treated mice. Similar to dimebon, DF302 effectively potentiated AMPA receptor-mediated currents, bound to the 5-HT6 receptor, inhibited mitochondrial permeability transition and displayed cytoprotective properties in cellular models of neurodegeneration. Thus, DF302 exerts multi-target effects on the key mechanisms of neurodegenerative pathologies and can be considered as an optimized novel analogue of the neuroprotective agent dimebon.
Читать
тезис
|
Computer-assisted cystoscopy diagnosis of bladder cancer
|
|
Звягин Андрей Васильевич (Заведующий отделом Биоинженерии)
|
Urologic Oncology: Seminars and Original Investigations |
|
|
Одним из наиболее надежных методов диагностики рака мочевого пузыря является цистоскопия. В зависимости от результатов, это может сопровождаться направлением к более опытному урологу или биопсией и гистологическим анализом подозрительного поражения. В этой работе мы исследуем, может ли компьютерная сортировка результатов цистоскопии идентифицировать поражения с низким риском и уменьшить количество направлений или биопсий, связанных с ними осложнений и затрат, хотя и снижает субъективность процедуры и указывает, когда риск поражения является злокачественная минимальна.
Читать
тезис
Публикация |
Genetically-modified bone mesenchymal stem cells with TGF-β3 improve wound healing and reduce scar tissue formation in a rabbit model
|
|
Люндуп Алексей Валерьевич (Заведующий отделом)
|
EXPERIMENTAL CELL RESEARCH |
|
|
Обширное образование рубцовой ткани часто происходит после тяжелой ожоговой травмы, травмы или как одно из осложнений после хирургического вмешательства. Несмотря на значительные терапевтические успехи, все еще остается серьезной проблемой управлять формированием массивной рубцовой ткани, одновременно способствуя нормальному заживлению ран. Целью данного исследования было изучение терапевтического эффекта костных мезенхимальных стволовых клеток (BMSCs), которые были генетически модифицированы для сверхэкспрессии трансформирующего фактора роста-бета 3 (TGF-β 3).), ингибитор пролиферации миофибробластов и отложения коллагена I типа, на заживление кожных ран полной толщины на модели кролика. Двадцать четыре кролика с хирургически индуцированными кожными ранами полной толщины, созданными на внешнем ухе (1,5 × 1,5 см, две раны / ухо), были рандомизированы на четыре группы: (G1), раны без специальной обработки, но с обычной бессывороточной культурой средний как отрицательный контроль; (G2) местно применяемый рекомбинантный аденовирус, экспрессирующий TGF-β 3 / GFP; (G3), только для местного применения BMSC; (G4), местно применяемые BMSC, трансфицированные Ad-TGF-β 3 / GFP (BMSCs TGF-β3); и (G5), дополнительный нормальный контроль (n = 2) без раны или обработки кожи наружного уха. Размеры ран на тканях уха были тщательно исследованы, а глубина рубца и плотность ран были оценены гистологически через 21, 45 и 90 дней после создания хирургической раны. Наши результаты показали, что G4 значительно уменьшил глубину и плотность рубцов на ране по сравнению с G1 ~ 3. Количество клеток, экспрессирующих GFP, значительно увеличилось в G4 по сравнению с G2. Экспрессия белка TGF-β 3 и коллагена типа III в G4 значительно увеличилась, в то время как отношение типа I к коллагену типа III также значительно уменьшилось, что аналогично структуре ткани, обнаруженной в G5, по сравнению с другими группами лечения. В заключение трансплантация BMSCs TGF-β3 значительно улучшает заживление ран и уменьшает образование рубцовой ткани кожи на животной модели, что потенциально может предоставить альтернативу в лечении обширного образования рубцовой ткани после повреждения мягких тканей.
Читать
тезис
Публикация |
Using a simple equation to predict the microporation-enhanced transdermal drug flux
|
|
Ржевский Алексей Сергеевич (Младший научный сотрудник)
|
European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics |
|
|
Математическая модель, описывающая поток лекарственного средства через микропорированную кожу, была разработана ранее. Основываясь на этой модели, можно использовать два математических уравнения для прогнозирования трансдермального потока лекарств с усилением микропорации: комплексное первичное уравнение, содержащее множество экспериментально определенных переменных, и упрощенное простое уравнение. В этом исследовании были измерены экспериментальные трансдермальные потоки трех кортикостероидов через кожу человека разделенной толщины, обработанную валиком с микроиглами, и значения потоков по сравнению с предсказанными с использованием более сложных и упрощенных уравнений. Согласно результатам исследования, оба уравнения продемонстрировали высокую точность в прогнозировании потоков кортикостероидов. Упрощенное уравнение было подтверждено и подтверждено как надежное с использованием регрессионного анализа литературных данных.
Читать
тезис
Публикация |
Microneedles as the technique of drug delivery enhancement in diverse organs and tissues
|
|
Ржевский Алексей Сергеевич (Младший научный сотрудник)
|
Journal of Controlled Release |
|
|
Microneedles is the technique of drug delivery enhancement, which was primarily designed for facilitating percutaneous drug delivery. Started from the development of simple solid microneedles, providing microporation of stratum corneum and therefore enhancement of topical drug delivery, for two decades the technique has progressed in various modifications such as hollow, coated, dissolving and hydrogel forming microneedles. In their turn, the modifications have resulted in new mechanisms of drug delivery enhancement and followed by the expansion of applicability range in terms of targeted tissues and organs. Thus, in addition to percutaneous drug delivery, microneedles have been considered as an efficient technique facilitating ocular, oral mucosal, gastrointestinal, ungual and vaginal drug administration. It is anticipated that the technique of microneedle-assisted drug delivery will soon become relevant for majority of organs and tissues.
Читать
тезис
Публикация |
Loss of heterozygosity and uniparental disomy of chromosome region 10q23.3–26.3 in glioblastoma
|
|
Залетаев Дмитрий Владимирович (главный научный сотрудник лаборатории медицинской генетики)
Алексеева Екатерина Александровна (н.с. Лаборатории эпигенетики ФГБНУ Медико-генетический научный центр РАН)
Кузнецова Екатерина Борисовна (ведущий научный сотрудник лаборатории медицинской генетики)
|
Genes Chromosomes and Cancer |
|
|
Glioblastoma is the most frequent and aggressive brain tumor in the adult population. Loss of heterozygosity (LOH) at markers of the long arm of chromosome 10 is the most common genetic alteration in glioblastoma, being detectable in up to 80% of cases. We have tested 124 glioblastoma samples for LOH by microsatellite analysis of the 10q23.3–26.3 region which contains the cancer related genes PTEN, FGFR2, MKI67, and MGMT. Then, a real‐time quantitative microsatellite analysis (QuMA) was used to qualitatively estimate the change in copy number of this region in the samples with LOH. LOH was detected in 62.1% of the glioblastoma samples. A total of 64 samples with LOH in this region were examined by QuMA. LOH was attributed to a deletion in 37.5% of cases, and uniparental disomy (UPD) in 25% of cases. In 37.5% of cases, deletion and UPD segments alternated within the region: deletions being more frequent than UPD in its proximal part (encompassing PTEN and FGFR2) and both deletions and UPD occurring at the same frequency in its distal part (MGMT). Thus, we have investigated mechanisms of structural alterations of the chromosome region 10q23.3–26.3 in glioblastoma. In addition to a structural deletion of this region, UPD was identified as a frequent cause of LOH. We resume that more detailed studies of glioblastoma at the molecular genetic level are essential in search for potential markers suitable for predicting the disease outcome and the response to treatment.
Читать
тезис
|
KISS1 tumor suppressor restricts angiogenesis of breast cancer brain metastases and sensitizes them to oncolytic virotherapy in vitro
|
|
Платонов М.Е (старший научный сотрудник, лаборатория молекулярной биохимии)
Уласов И.В (внештатный научный сотрудник, лаборатория молекулярной биохимии)
|
CANCER LETTERS |
|
|
Белок-супрессор опухолей KISS1 регулирует инвазию раковых клеток с помощью металлопротеиназы MMP9. Снижение экспрессии гена KISS1 способствует прогрессированию рака молочной железы и меланомы, что приводит к развитию отдаленных метастазов. В настоящем исследовании мы исследовали, является ли восстановление экспрессии KISS1 в клетках метастатического рака молочной железы человека с дефицитом KISS1 потенциалом в качестве передовой противоопухолевой стратегии. С этой целью мы разработали условно-репликативный человеческий аденовирус типа 5 с повышенной инфекционностью, кодирующий KISS1 в качестве «вооруженного» трансгена в области E3 Ad5 для эктопической экспрессии KISS1 в трансдуцированных раковых клетках. Онколитический потенциал вектора был исследован с использованием метастатических клонов мозга, поражающих мозг, клеток CN34 и MDA-MB-231, которые поддерживали высокий уровень репликации AdKISS1, коррелирует с устойчивой CRAd-опосредованной цитотоксичностью. Секрецию клеточных факторов, ответственных за ангиогенез опухоли, межклеточную коммуникацию и противоопухолевые иммунные ответы при экспрессии KISS1 в клетках рака молочной железы, анализировали с помощью набора RayBiotech Kiloplex Quantibody. В целом, наши результаты показывают, что экспрессия трансгена KISS1 обеспечивает важное преимущество CRAd-опосредованной цитотоксичности в клетках рака молочной железы и обладает потенциалом в качестве противоракового лечения в сочетании с онколитической виротерапией молочной железы и других метастатических раков.
Читать
тезис
Публикация |
Biofabrication: A Guide to Technology and Terminology
|
|
Миронов В.А. (внештатный научный сотрудник)
|
Trends in Biotechnology |
|
|
Biofabrication holds the potential to generate constructs that more closely recapitulate the complexity and heterogeneity of tissues and organs than do currently available regenerative medicine therapies. Such constructs can be applied for tissue regeneration or as in vitro 3D models. Biofabrication is maturing and growing, and scientists with different backgrounds are joining this field, underscoring the need for unity regarding the use of terminology. We therefore believe that there is a compelling need to clarify the relationship between the different concepts, technologies, and descriptions of biofabrication that are often used interchangeably or inconsistently in the current literature. Our objective is to provide a guide to the terminology for different technologies in the field which may serve as a reference for the biofabrication community.
Читать
тезис
|
Characterization and Detection of Erythropoietin Fc Fusion Proteins Using Liquid Chromatography-Mass Spectrometry
|
|
Апполонова Светлана Александровна (Заведующая лабораторией)
|
Заведующая лабораторией JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH |
|
|
Erythropoietin Fc (EPO-Fc) fusion proteins are potential drug candidates that have been designed for the treatment of anemia in humans by stimulating erythrocyte production. Such compounds can be considered performance-enhancing agents that may be used by athletes in endurance sports. This study describes the primary structure of commercially available EPO-Fc based on comprehensive liquid chromatography coupled with mass spectrometry (LC–MS) analysis. A bottom-up approach and the intact molecular weight (MW) measurement of deglycosylated protein and its IdeS proteolytic fractions was used to determine the amino acid sequence of EPO-Fc. Using multiple proteases, peptides covering unknown fusion breakpoints (spacer peptides) were identified. We demonstrated that “spacer peptides” can be used in the determination of EPO-Fc fusion proteins in biological samples using common LC–tandem MS methods.
Читать
тезис
Публикация |
Phylodynamics of Crimean Congo hemorrhagic fever virus in South Russia
|
|
Девяткин Андрей Андреевич (старший научный сотрудник, лаборатория молекулярной биохимии)
Лукашев Александр Николаевич (Директор)
|
Infection, Genetics and Evolution |
|
|
Филодинамика крымского конго генотипа V вируса геморрагической лихорадки (CCHFV) на юге России была проанализирована с использованием 244 частичных (452-571 нт) последовательностей во всех трех геномных сегментах и 38 полных геномных последовательностей. Несмотря на увеличение числа последовательностей, русская линия европейского генотипа V (обычно называемая GtVa) отличалась от изолятов GtV из Турции и балканских стран. В филогенетической подгруппе CCHFV на юге России географического паттерна не наблюдалось. Идентичные изоляты могут быть обнаружены в отдаленных местах, разнесенных на сотни километров, тогда как в том же регионе циркулируют относительно разные вирусы. Полный анализ генома показал, что события реассортировки в GtVa происходили каждые несколько десятилетий (средний период полураспада нереассортантного узла 30-40 лет) и включали сегменты M и S. Следовательно,
Читать
тезис
Публикация |
Proton-independent activation of acidsensing ion channel 3 by an alkaloid, lindoldhamine, from Laurus nobilis
|
|
Андреев Ярослав Алексеевич (Заведующий лабораторией Молекулярной и клеточной биологии)
Осмаков Дмитрий Игоревич (старший научный сотрудник, лаборатория молекулярной и клеточной биологии)
|
British Journal of Pharmacology |
|
|
Acid-sensing ion channels (ASICs) play an important role in synaptic plasticity and learning, as well as in nociception and mechanosensation. ASICs are involved in pain and in neurological and psychiatric diseases, but their therapeutic potential is limited by the lack of ligands activating them at physiological pH.
EXPERIMENTAL APPROACH:
We extracted, purified and determined the structure of a bisbenzylisoquinoline alkaloid, lindoldhamine, (LIN) from laurel leaves. Its effect on ASIC3 channels were characterized, using two-electrode voltage-clamp electrophysiological recordings from Xenopus laevis oocytes.
KEY RESULTS:
At pH 7.4 or higher, LIN activated a sustained, proton-independent, current through rat and human ASIC3 channels, but not rat ASIC1a or ASIC2a channels. LIN also potentiated proton-induced transient currents and promoted recovery from desensitization in human, but not rat, ASIC3 channels.
CONCLUSIONS AND IMPLICATIONS:
We describe a novel ASIC subtype-specific agonist LIN, which induced proton-independent activation of human and rat ASIC3 channels at physiological pH. LIN also acts as a positive allosteric modulator of human, but not rat, ASIC3 channels. This unique, species-selective, ligand of ASIC3, opens new avenues in studies of ASIC structure and function, as well as providing new approaches to drug design.
Читать
тезис
Публикация |
Spontaneous formation of nanofilms under interaction of 4th generation pyrydylphenylene dendrimer with proteins
|
|
Стройлова Юлия Юрьевна (старший научный сотрудник, лаборатория молекулярной и клеточной биологии)
|
Polymer |
|
|
Использование материалов на основе белково-полимерных композиций является перспективным методом решения ряда задач в биотехнологии и медицине. В нашей работе мы создали многослойные нанопленки на основе пиридилфениленовых дендримеров 4-го поколения (G4) с периферией на основе пиридина, содержащей белковый компонент. Для молочных бета- и каппа-казеинов было обнаружено, что альфа-лактальбумин, рекомбинантный прионный белок овец, лизоцим, трипсин и альфа-химотрипсин способны интегрироваться в самоорганизующиеся структуры толщиной около 230-710 нм, измеренные с помощью атомно-силовой микроскопии. , Образование нанопленок зависит от соотношения белок / дендример в исходном растворе. В то же время нанопленки устойчивы к изменениям рН и действию моющих средств. Мы продемонстрировали, что трипсин и химотрипсин, включенные в нанопленки, все еще сохраняли протеолитическую активность и были стабильными в течение по меньшей мере 3 недель. Мы также провели in silico молекулярное моделирование взаимодействия G4-дендримера с лизоцимом. Пространственная структура дендример-белкового комплекса была предсказана, и наиболее вероятный вариант оставался практически нетронутым в условиях моделирования молекулярной динамики в течение 100 нс. Мы считаем, что белково-дендримерные системы являются перспективным инструментом для возможных применений при разработке новых стабильных биоматериалов и биосенсоров. Пространственная структура дендример-белкового комплекса была предсказана, и наиболее вероятный вариант оставался практически нетронутым в условиях моделирования молекулярной динамики в течение 100 нс. Мы считаем, что белково-дендримерные системы являются перспективным инструментом для возможных применений при разработке новых стабильных биоматериалов и биосенсоров. Пространственная структура дендример-белкового комплекса была предсказана, и наиболее вероятный вариант оставался практически нетронутым в условиях моделирования молекулярной динамики в течение 100 нс. Мы считаем, что белково-дендримерные системы являются перспективным инструментом для возможных применений при разработке новых стабильных биоматериалов и биосенсоров.
Читать
тезис
Публикация |
Cyclic AMP Pathway Suppress Autoimmune Neuroinflammation by Inhibiting Functions of Encephalitogenic CD4 T Cells and Enhancing M2 Macrophage Polarization at the Site of Inflammation
|
|
Люндуп А.В. (заведующий отделом передовых клеточных технологий)
Стрекалова Т.В. (Зам. Руководителя лаборатории психиатрической нейробиологии)
Помыткин И.А (ст.научн сотрудник отдела передовых клеточных технологий)
|
FRONTIERS IN IMMUNOLOGY |
|
|
Хотя было продемонстрировано, что путь цАМФ влияет как на адаптивные, так и на врожденные функции клеток, роль этого пути в регуляции аутоиммунного воспаления центральной нервной системы (ЦНС), вызванного Т-клетками, такого как экспериментальный аутоиммунный энцефаломиелит (ЭАЭ), остается. неясно. Также неясно, как путь цАМФ влияет на функцию CD4 Т-клеток in vivo.на месте воспаления. Мы обнаружили, что активатор аденилатциклазы форсколин помимо ингибирования функций аутоиммунных CD4 T-клеток также активирует микроРНК (miR) -124 в ЦНС во время EAE, что связано с фенотипом M2 микроглии / макрофагов. Наше исследование также установило, что в дополнение к прямому влиянию пути цАМФ на CD4 Т-клетки, стимуляция этого пути способствовала поляризации макрофагов в направлении М2, приводя к косвенному ингибированию функции Т-клеток в ЦНС. Мы продемонстрировали, что форсколин вместе с IL-4 или форсколином вместе с IL-4 и IFNγ эффективно стимулировал фенотип М2 макрофагов, что указывает на высокую активность этого пути при перепрограммировании поляризации макрофагов в Th2- и даже в воспалительных состояниях, смешанных с Th1 / Th2, таких как как EAE. Механически, Форсколин и / или IL-4 активируют путь ERK в макрофагах, что приводит к усилению регуляции M2-ассоциированных молекул miR-124, аргиназы (Arg) 1 и рецептора маннозы C-типа 1 (Mrc1), которые были обращены ингибиторами ERK. Введение форсколина после начала ЭАЭ существенно положительно регулировало маркеры М2 Arg1, Mrc1, Fizz1 и Ym1 и ингибировало маркеры М1 синтетазы оксида азота 2 и CD86 в ЦНС во время ЭАЭ, приводя к снижению активации макрофагов / микроглии, лимфоцитов и CD4 Т-клеток. и выздоровление от болезни. Форсколин ингибировал пролиферацию и продукцию IFNγ CD4 T-клетками в ЦНС, но оказывал довольно слабое прямое влияние на пролиферацию аутоиммунных T-клеток на периферии и который был полностью изменен ингибиторами ERK. Введение форсколина после начала ЭАЭ существенно положительно регулировало маркеры М2 Arg1, Mrc1, Fizz1 и Ym1 и ингибировало маркеры М1 синтетазы оксида азота 2 и CD86 в ЦНС во время ЭАЭ, приводя к снижению активации макрофагов / микроглии, лимфоцитов и CD4 Т-клеток. и выздоровление от болезни. Форсколин ингибировал пролиферацию и продукцию IFNγ CD4 T-клетками в ЦНС, но оказывал довольно слабое прямое влияние на пролиферацию аутоиммунных T-клеток на периферии и который был полностью изменен ингибиторами ERK. Введение форсколина после начала ЭАЭ существенно положительно регулировало маркеры М2 Arg1, Mrc1, Fizz1 и Ym1 и ингибировало маркеры М1 синтетазы оксида азота 2 и CD86 в ЦНС во время ЭАЭ, приводя к снижению активации макрофагов / микроглии, лимфоцитов и CD4 Т-клеток. и выздоровление от болезни. Форсколин ингибировал пролиферацию и продукцию IFNγ CD4 T-клетками в ЦНС, но оказывал довольно слабое прямое влияние на пролиферацию аутоиммунных T-клеток на периферии и инфильтрация лимфоцитов и CD4 Т-клеток и выздоровление от болезни. Форсколин ингибировал пролиферацию и продукцию IFNγ CD4 T-клетками в ЦНС, но оказывал довольно слабое прямое влияние на пролиферацию аутоиммунных T-клеток на периферии и инфильтрация лимфоцитов и CD4 Т-клеток и выздоровление от болезни. Форсколин ингибировал пролиферацию и продукцию IFNγ CD4 T-клетками в ЦНС, но оказывал довольно слабое прямое влияние на пролиферацию аутоиммунных T-клеток на периферии иin vitro , что свидетельствует о распространенности косвенного влияния форсколина на дифференцировку и функции аутоиммунных CD4 T-клеток in vivo . Таким образом, наши данные указывают на то, что форсколин обладает способностью нарушать баланс в сторону М2, воздействуя на путь ERK в макрофагах, и косвенно ингибировать патогенные CD4 Т-клетки в ЦНС, что приводит к подавлению аутоиммунного воспаления. Эти данные могут также иметь значение для будущих терапевтических подходов к ингибированию аутоиммунных клеток Th1 в месте воспаления ткани.
Читать
тезис
Публикация |
Cell therapy for stress urinary incontinence: Present-day frontiers
|
|
Бутнару Д.В. (Директор)
|
Journal of Tissue Engineering and Regenerative Medicine |
|
|
Stress urinary incontinence (SUI) significantly diminishes the quality of patients' lives. Currently available surgical and nonsurgical therapies remain far from ideal. At present, advances in cellular technologies have stirred growing interest in the use of autologous cell treatments aimed to regain urinary control. The objective was to conduct a review of the literature and analyse preclinical and clinical studies dedicated to various cell therapies for SUI, assessing their effectiveness, safety, and future prospects. A systematic literature search in PubMed was conducted using the following key terms: “stem,” “cell,” “stress,” “urinary,” and “incontinence.” A total of 32 preclinical studies and 15 clinical studies published between 1946 and December 2014 were included in the review. Most preclinical trials have used muscle‐derived stem cells and adipose‐derived stem cells. However, at present, the application of other types of cells, such as human amniotic fluid stem muscle‐derived progenitor cells and bone marrow mesenchymal stromal cells, is becoming more extensive. While the evidence shows that these therapies are effective and safe, further work is required to standardize surgical techniques, as well as to identify indications for their use, doses and number of doses. Future research will have to focus on clinical applications of cell therapies; namely, it will have to determine indications for their use, doses of cells, optimal surgical techniques and methods, attractive cell sources, as well as to develop clinically relevant animal models and make inroads into understanding the mechanisms of SUI improvement by cell therapies.
Читать
тезис
Публикация |
Recombination in the rabies virus and other lyssaviruses
|
|
Девяткин Андрей Андреевич (старший научный сотрудник, лаборатория молекулярной биохимии)
Лукашев Александр Николаевич (Директор ФГБНУ ИПВЭ им.М.П.Чумакова, зав.лаб, НИИМПиТМ им.Е.И.Марциновского, Первого МГМУ им. И.М.Сеченова в.н.с.)
|
Infection, Genetics and Evolution |
|
|
Recombination is a common event in RNA viruses; however, in the rabies virus there have been only a few reports of isolated recombination events. Comprehensive analysis found traces of recent recombination events within Arctic, Arctic-like and Africa 1b rabies virus groups, as well as recombination between distinct lyssaviruses. Recombination breakpoints were not linked to gene boundaries and could be detected all over the genome. However, there was no evidence that recombination is an important factor in the genetic variability of the rabies virus. It is therefore likely that recombination in the rabies virus is limited by ecological factors (e.g., rare co-circulation of distinguishable lineages and a narrow window for productive coinfection in most carnivore hosts), rather than molecular barriers (e.g., incompatibility of genome fragments).
Читать
тезис
Публикация |
High-resolution 3D photopolymerization assisted by upconversion nanoparticles for rapid prototyping applications
|
|
Савельев Александр Георгиевич (младший научный сотрудник, лаборатория лазерной биомедицины ФНИЦ и лаборатории фотонной биоинженерии)
Хайдуков Евгений Валерьевич (Заведующий лаборатория лазерной биомедицины ФНИЦ и лаборатории фотонной биоинженерии)
Гуллер Анна Евгеньевна (старший научный сотрудник лаборатории экспериментальной морфологии)
Королева Анастасия Валерьевна (старший научный сотрудник отдела современных биоматериалов)
|
Scientific REPORTS |
|
|
Была исследована трехмерная (3D) технология быстрого прототипирования, основанная на полимеризации фотоотверждаемых композиций, содержащих наноматериалы с повышением частоты, в ближней инфракрасной области спектра. Для этой цели были разработаны рационально разработанные наночастицы NaYF 4 : Yb 3+ , Tm 3+ / NaYF 4 с восходящим преобразованием ядра и оболочки с четко выраженными ультрафиолетовыми излучающими линиями и беспрецедентно высокой эффективностью преобразования ближнего инфракрасного спектра в ультрафиолетовый были использованы. Преобразованные с повышением частоты ультрафиолетовые фотоны были способны эффективно активировать фотоинициаторы, содержащиеся в светочувствительных смолах, при умеренной интенсивности возбуждения NIR ниже 10 Вт см -2.{\eta }_{{\bf{UC}}}^{({\bf{UV}})}=2{\boldsymbol{ \% }}и индуцировать образование радикалов и фотополимеризацию in situ . Был исследован процесс полимеризации в ближней инфракрасной области, как в миллиметровом, так и в субмикронном масштабе. Полимерные макро- и микроструктуры были изготовлены методом лазерной сканирующей фотолитографии ближнего инфракрасного диапазона в объеме жидких фотоотверждаемых композиций с сфокусированным лазерным излучением на длине волны 975 нм. Исследование процесса полимеризации в окрестности наночастиц показывает сильные различия в скорости роста полимерной оболочки на плоской и краевой сторонах наночастиц. Это явление в основном определяет разрешение продемонстрированной технологии ближней инфракрасной и ультрафиолетовой 3D-печати на уровне микрометрового масштаба.
Читать
тезис
Публикация |
ANCA-associated vasculitis: mission incomplete?
|
|
Моисеев Сергей Валентинович (Профессор)
Новиков Павел Игоревич (Ведущий научный сотрудник)
|
ANNALS OF THE RHEUMATIC DISEASES |
|
|
За последние десятилетия введение высоких доз кортикостероидов и иммунодепрессантов и последующего ритуксимаба в современные алгоритмы индукции и поддерживающей терапии ремиссии привело к значительному улучшению выживаемости пациентов с вазулитидами, ассоциированными с антинейтрофильными цитоплазматическими антителами (ANCA). , Тем не менее, в недавнем метаанализе обсервационных исследований Tan et al. Показали 2,7-кратный повышенный риск смерти у пациентов с AAV по сравнению с общей популяцией. 1Примечательно, что в последние годы наблюдалась тенденция к снижению смертности по сравнению с более ранними когортами. В нашем собственном исследовании у 242 пациентов с гранулематозом с полиангиитом мы также обнаружили значительное снижение смертности в последние годы (2004–2012 гг. По сравнению с 1970–2003 гг .; р = 0,04) и сдвиг в сторону более высокого процента сердечно-сосудистых событий и осложнений. иммуносупрессия как причины смерти. 2
Результаты метаанализа Tan et al. Не удивительны и позволяют предположить, что AAV, особенно если его не диагностировать и своевременно не лечить, остается опасным для жизни заболеванием и требует надлежащего лечения. Подводные камни текущего лечения AAV хорошо известны и включают относительно частые рецидивы, особенно у ANCA-положительных пациентов с протеиназой-3 (PR3) (до 50% в течение 5 лет), отсроченную диагностику и позднее начало лечения в пропорции пациенты, высокий уровень терминальной стадии почечной недостаточности (ТПН), которая не претерпела существенных изменений в текущую эпоху, неизвестная оптимальная продолжительность поддерживающей терапии, бремя иммуносупрессии (например, инфекции и злокачественные новообразования) и повышенный риск сердечно-сосудистых и тромбоэмболических осложнений , которые могут быть связаны ...
Читать
тезис
Публикация |