Recombination in the rabies virus and other lyssaviruses
|
|
Девяткин Андрей Андреевич
Лукашев Александр Николаевич
|
Infection, Genetics and Evolution |
|
|
Recombination is a common event in RNA viruses; however, in the rabies virus there have been only a few reports of isolated recombination events. Comprehensive analysis found traces of recent recombination events within Arctic, Arctic-like and Africa 1b rabies virus groups, as well as recombination between distinct lyssaviruses. Recombination breakpoints were not linked to gene boundaries and could be detected all over the genome. However, there was no evidence that recombination is an important factor in the genetic variability of the rabies virus. It is therefore likely that recombination in the rabies virus is limited by ecological factors (e.g., rare co-circulation of distinguishable lineages and a narrow window for productive coinfection in most carnivore hosts), rather than molecular barriers (e.g., incompatibility of genome fragments).
Читать
тезис
Публикация |
Molecular and clinical aspects of embryotoxicity induced by acetylcholinesterase inhibitors
|
|
Бурыкина Татьяна Ивановна
|
Toxicology |
|
|
Acetylcholinesterase inhibitors are widely used for a variety of medical, agricultural and public health purposes. Consequently, exposure is highly possible during lifetime. However, their systematic use raises concerns for the potential impact on the fetus and newborn since these substances may affect angiogenesis, the neonatal and maternal intensive care, neuroimmune function and response, mammary growth/lactation via cholinergic/non-cholinergic central and peripheral neuroendocrine pathways. New methodologies, neuroscientific technologies and research studies are needed to harness existing knowledge along with the proper management, availability for new acetylcholinesterase inhibitors, with stable pharmacodynamics and clinical outcomes.
Читать
тезис
Публикация |
Indispensable Role of Proteases in Plant Innate Immunity
|
|
Замятнин Андрей Александрович (директор)
|
International Journal of Molecular Sciences |
|
|
Plant defense is achieved mainly through the induction of microbe-associated molecular patterns (MAMP)-triggered immunity (MTI), effector-triggered immunity (ETI), systemic acquired resistance (SAR), induced systemic resistance (ISR), and RNA silencing. Plant immunity is a highly complex phenomenon with its own unique features that have emerged as a result of the arms race between plants and pathogens. However, the regulation of these processes is the same for all living organisms, including plants, and is controlled by proteases. Different families of plant proteases are involved in every type of immunity: some of the proteases that are covered in this review participate in MTI, affecting stomatal closure and callose deposition. A large number of proteases act in the apoplast, contributing to ETI by managing extracellular defense. A vast majority of the endogenous proteases discussed in this review are associated with the programmed cell death (PCD) of the infected cells and exhibit caspase-like activities. The synthesis of signal molecules, such as salicylic acid, jasmonic acid, and ethylene, and their signaling pathways, are regulated by endogenous proteases that affect the induction of pathogenesis-related genes and SAR or ISR establishment. A number of proteases are associated with herbivore defense. In this review, we summarize the data concerning identified plant endogenous proteases, their effect on plant-pathogen interactions, their subcellular localization, and their functional properties, if available, and we attribute a role in the different types and stages of innate immunity for each of the proteases covered. View Full-Text
Читать
тезис
Публикация |
Recombination in the rabies virus and other lyssaviruses
|
|
Девяткин Андрей Андреевич (старший научный сотрудник, лаборатория молекулярной биохимии)
Лукашев Александр Николаевич (Директор ФГБНУ ИПВЭ им.М.П.Чумакова, зав.лаб, НИИМПиТМ им.Е.И.Марциновского, Первого МГМУ им. И.М.Сеченова в.н.с.)
|
Infection, Genetics and Evolution |
|
|
Recombination is a common event in RNA viruses; however, in the rabies virus there have been only a few reports of isolated recombination events. Comprehensive analysis found traces of recent recombination events within Arctic, Arctic-like and Africa 1b rabies virus groups, as well as recombination between distinct lyssaviruses. Recombination breakpoints were not linked to gene boundaries and could be detected all over the genome. However, there was no evidence that recombination is an important factor in the genetic variability of the rabies virus. It is therefore likely that recombination in the rabies virus is limited by ecological factors (e.g., rare co-circulation of distinguishable lineages and a narrow window for productive coinfection in most carnivore hosts), rather than molecular barriers (e.g., incompatibility of genome fragments).
Читать
тезис
Публикация |
Molecular and clinical aspects of embryotoxicity induced by acetylcholinesterase inhibitors
|
|
Бурыкина Татьяна Ивановна (Доцент)
|
Toxicology |
|
|
Acetylcholinesterase inhibitors are widely used for a variety of medical, agricultural and public health purposes. Consequently, exposure is highly possible during lifetime. However, their systematic use raises concerns for the potential impact on the fetus and newborn since these substances may affect angiogenesis, the neonatal and maternal intensive care, neuroimmune function and response, mammary growth/lactation via cholinergic/non-cholinergic central and peripheral neuroendocrine pathways. New methodologies, neuroscientific technologies and research studies are needed to harness existing knowledge along with the proper management, availability for new acetylcholinesterase inhibitors, with stable pharmacodynamics and clinical outcomes.
Читать
тезис
Публикация |
A conserved region in the Closterovirus 1a polyprotein drives extensive remodeling of endoplasmic reticulum membranes and induces motile globules in Nicotianabenthamiana cells.
|
|
Соловьев А. Г. (Ведущий научный сотрудник, лаборатория молекулярной биологии и биохимии, Институт молекулярной медицины)
Шария М.А. (Профессор)
Несвижский Юрий Владимирович (Профессор)
|
Virology |
|
|
Репликативный полипротеин 1а вируса желтухи свеклы (ВЖС) содержит консервативные домены лидерной папаин-подобной протеиназы (РСР), метилтрансферазы (MTR) и РНК хеликазы (HEL). Центральный район (central region, CR) между MTR и HEL ранее считали «вариабельным». Нами проведен компьютерный анализ CR, который позволил выявить новый консервативный домен между позициями 1287-1390 (здесь и далее приводится нумерация аминокислотных остатков белка 1а вируса желтухи свеклы, BYV), сохраняющийся у всех представителей рода Closterovirus. Этот домен содержит 4 предсказанных альфа-спиральных участка (альфа А – D) и три строго консервативные позиции – глютамат-1291, пролин-1380 и аргинин-1384. Кроме того, биоинформатический анализ позволил предсказать амфипатическую спираль в позициях 1368-1380 (входящую в состав участка альфа D). Гидрофобный домен CR-2 (позиции 1305-1494 белка 1а), вызывающий при экспрессии в растениях реструктуризацию эндоплазматического ретикулюма и образование подвижных глобул диаметром ~1 мкм, включает участки альфа В, С и D. Установлено, что экспрессия в растениях слитных белков CR-2:GFP и GFP:CR-2 вызывает сходный «глобулообразующий» фенотип, т.е. N-концевое или C-концевое положение маркера GFP в слитном белке не влияет на переформатирование мембран эндоплазматического ретикулюма. Проведен делеционный анализ CR-2 BYV. Показано, что делеционные варианты 1355-1494 и 1325-1484 сохраняют фенотип дикого типа (образование глобул и реструктуризация ЭР вокруг ядра клетки). Варианты 1375-1484, 1368-1484 и 1368-1432 индуцировали образование глобул, но утрачивали способность к реструктуризации ЭР. Внесение замен гидрофобных аминокислотных остатков на остатки серина и глицина в «минимальном» делеционном мутанте 1368-1432 блокировало образование глобул. Предложена рабочая гипотеза о влиянии консервативной амфипатической спирали 1368-1385 в белке 1а BYV на ремоделирование мембран ЭР растительной клетки и создание репликативных платформ при клостеровирусной инфекции.
Читать
тезис
Публикация |
Phylogenetic and functional analyses of a plant protein related to human B-cell receptor-associated proteins.
|
|
Соловьев А. Г. (Ведущий научный сотрудник, лаборатория молекулярной биологии и биохимии, Институт молекулярной медицины)
Шария М.А. (Профессор)
Несвижский Юрий Владимирович (Профессор)
|
Biochimie |
|
|
Human B-cell receptor-associated protein BAP31 (HsBAP31) is the endoplasmic reticulum-resident protein involved in protein sorting and transport as well as pro-apoptotic signaling. Plant orthologs of HsBAP31 termed 'plant BAP-like proteins' (PBL proteins) have thus far remained unstudied. Recently, the PBL protein from Nicotiana tabacum (NtPBL) was identified as an interactor of Nt-4/1, a plant protein known to interact with plant virus movement proteins and affect the long-distance transport of potato spindle tuber viroid (PSTVd) via the phloem. Here, we have compared the sequences of PBL proteins and studied the biochemical properties of NtPBL. Analysis of a number of fully sequenced plant genomes revealed that PBL-encoding genes represent a small multigene family with up to six members per genome. Two conserved motifs were identified in the C-terminal region of PBL proteins. The NtPBL C-terminal hydrophilic region (NtPBL-C) was expressed in bacterial cells, purified, and used for analysis of its RNA binding properties in vitro. In gel shift experiments, NtPBL-C was found to bind several tested RNAs, showing the most efficient binding to microRNA precursors (pre-miRNA) and less efficient interaction with PSTVd. Mutational analysis suggested that NtPBL-C has a composite RNA-binding site, with two conserved lysine residues in the most C-terminal protein region being involved in binding of pre-miRNA but not PSTVd RNA. Virus-mediated transient expression of NtPBL-C in plants resulted in stunting and leaf malformation, developmental abnormalities similar to those described previously for blockage of miRNA biogenesis/function. We hypothesize that the NtPBL protein represents a previously undiscovered component of the miRNA pathway.
Читать
тезис
Публикация |
Нейровизуализационные методы в диагностике и терапии депрессивных расстройств
|
|
Волель Б. А. (Профессор)
Шария М. А. (Профессор)
Несвижский Юрий Владимирович (Профессор)
|
Журнал неврологии и психиатрии им. С. С. Корсакова |
|
|
В области изучения нейробиологии униполярных депрессивных расстройств (УДР) перспективными считаются нейровизуализационные методы, особенно позитронно-эмиссионная томография (ПЭТ) и функциональная магнитно-резонансная томография (фМРТ). В статье приводится обзор современных нейровизуализационных данных, касающихся структурно-функциональных особенностей головного мозга у лиц, страдающих УДР. Результаты отдельных исследований представлены в зависимости от особенностей методов их проведения (состояние покоя, выполнение когнитивных и эмоциональных тестов) и соотнесены с основными нейробиологическими концепциями развития депрессивных расстройств. Отдельно рассмотрены возможности нейровизуализационных исследований для оценки и прогнозирования результатов антидепрессивной терапии.
Читать
тезис
Публикация |
ПРИМЕНЕНИЕ СИНТЕТИЧЕСКИХ ОСТЕОПЛАСТИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ ДЛЯ УВЕЛИЧЕНИЯ ПАРАМЕТРОВ АЛЬВЕОЛЯРНОЙ КОСТИ ЧЕЛЮСТЕЙ ПЕРЕД ДЕНТАЛЬНОЙ ИМПЛАНТАЦИЕЙ
|
|
Тарасенко С. В. (Заведующая кафедрой)
Ершова А.М. (Ассистент)
Несвижский Юрий Владимирович (Профессор)
|
СТОМАТОЛОГИЯ |
|
|
Проведен анализ научной литературы за период с 1991 по 2016 г., посвященной хирургической подготовке костной ткани челюстей к дентальной имплантации путем применения синтетических остеопластических материалов. Подбор научной литературы проводился в Центральной научной медицинской библиотеке, электронной медицинской библиотеке eLIBRARY.RU, а также по базе данных медицинских публикаций PubMed. В обзоре проанализированы результаты экспериментальных и клинических исследований особенностей и эффективности применения таких материалов, сроки их замещения на новообразованную костную ткань, а также эффективность применения синтетических заменителей и других видов остеопластических материалов.
Читать
тезис
Публикация |
CRP, D-Dimer, fibrinogen and ESR as predictive markers of response to standard doses of levocetirizine in patients with chronic spontaneous urticaria
|
|
Колхир П. В. (Старший научный сотрудник)
Олисова О. Ю. (Заведующая кафедрой)
Несвижский Юрий Владимирович (Профессор)
|
European Annals of Allergy and Clinical Immunology |
|
|
According to current guidelines, non-sedative H1-antihistamines (nsAH) are the first-line therapy of chronic spontaneous urticaria (CSU). But even up-dosed antihistamines (to four times the standard dose) produce symptom resolution in less than 50% of patients. Biomarkers that can predict the response to nsAH are still unknown. We carried out a prospective study and used discriminant analysis to evaluate the combination of D-dimer, fibrinogen, C-reac-
tive protein and ESR values for predicting the outcome of treatment with levocetirizine in 84 CSU patients. We found that elevation of these parameters is associated with more active disease, low quality of life and lack of response to standard doses of levocetirizine. Thus, eval-uation of these markers may be considered useful before starting treatment with nsAH. The mechanisms behind the increase in these parameters in CSU patients need to be elucidated in further studies.
Читать
тезис
Публикация |