Среди всех заболеваний, которыми занимаются сотрудники клиники и кафедры, особое место занимает сахарный диабет. Это заболевание, несмотря на большой прогресс в изучении его генеза и успехи в лечении, по-прежнему, представляет собой огромную медицинскую и социальную проблему. Внедрение в клиническую практику «Школы для больных сахарным диабетом» позволило существенно повысить качество диабетологической помощи и снизить процент поздних (сосудистых и органных) осложнений сахарного диабета. В настоящее время в клинике также открыта «Школа для больных с ожирением», в рамках которой проводится активная работа по обучению и лечению больных с избыточной массой тела.
Среди приоритетных направлений работы кафедры можно выделить тиреоидологию. За прошедшие десятилетия сотрудниками кафедры было проведено большое число клинических работ, посвященных ранней диагностике и лечению йододефицитных заболеваний, болезни Грейвса, гипотиреоза, тиреоидитов. Разработаны методы диагностики и лечения тиреоидной патологии во время беременности.
На протяжении многих лет в клинике эндокринологии активно разрабатывается проблема гипоталамо-гипофизарных нарушений, к которым относятся такие заболевания как гиперпролактинемический гипогонадизм, болезнь Иценко-Кушинга, акромегалия, гипоталамо-гипофизарная недостаточность, несахарный диабет. Налажены способы ранней диагностики гормональноактивных опухолей гипофиза, созданы алгоритмы диагностического поиска, а также подбора оптимальных методов лечения. На базе клиники создан и активно поддерживается Московский регистр больных с акромегалией, позволяющий накапливать данные о пациентах, своевременно оказывать им высокотехнологичную помощь и динамически наблюдать за их состоянием. В клинике успешно проводится лечение больных с заболеваниями надпочечников, нарушениями физического и полового развития, патологией фосфорно-кальциевого обмена (гипер- гипопаратиреоз). В последние годы приоритетным направлением является изучение клинико-экономических аспектов эндокринной патологии в условиях современного здравоохранения.