Отдел клинической фармакологии, основанный в 1972 году, по праву считается "родоначальником" кафедры, ставшей первой кафедрой клинической фармакологии в СССР. С момента создания и по сентябрь 2017 года её возглавлял академик РАН, заслуженный деятель науки, почетный заведующий кафедрой, доктор медицинских наук - профессор Владимир Григорьевич Кукес. В настоящий момент заведующей кафедрой клинической фармакологии и пропедевтики внутренних болезней является доктор медицинских наук, профессор Ших Евгения Валерьевна.
Педагогическая, лечебная и научная работа - главные составляющие жизни кафедры, обучение на которой в настоящий момент проходят студенты лечебного, стоматологического, педиатрического факультетов, дирекции образовательных программ Международной школы "Медицина будущего", Центра международного образования. Кафедра клинической фармакологии и пропедевтики внутренних болезней составляет пул тех немногочисленных кафедр Сеченовского университета, что реализуют обучение по различным учебным дисциплинам на протяжении всего периода обучения в вузе - от изучения основ ухода за больными на 1 курсе до погружения в мир клинической фармакологии на 6 году обучения. Кроме того, ежегодно в стенах кафедры проводится элективный курс по актуальным вопросам фармакогенетики для студентов выпускных курсов. Преподавание ведётся как на русском, так и на английском языках.
Выпускники могут продолжить получать медицинское образование на кафедре путем прохождения программ клинической ординатуры (доступные направления: терапия и клиническая фармакология) и аспирантуры (клиническая фармакология и внутренние болезни).
Сегодня учебно-практические занятия кафедры проводятся сразу на нескольких клинических базах, среди которых городские клинические больницы №4 («Павловская больница») и № 70 (имени Е.О.Мухина), Центральная клиническая больница гражданской авиации.
Основными направлениями научной работы кафедры являются: