Год публикации:
Все года
2018
2019
2020
| Название |
Дата публикации |
Коллектив авторов |
Журнал |
DOI |
Индекс цитирования |
Ссылка на источник |
|
Phylodynamics of Crimean Congo hemorrhagic fever virus in South Russia
|
01.04.2018 |
Lukashev A.
Deviatkin A.
|
Infection, Genetics and Evolution |
|
3 |
Ссылка
© 2018 Elsevier B.V. Phylodynamics of Crimean Congo Hemorrhagic fever virus (CCHFV) genotype V in South Russia was analyzed using 244 partial (452–571 nt) sequences in all three genomic segments and 38 complete genomic sequences. Despite increased number of sequences, the Russian lineage of the European genotype V (commonly termed GtVa) was distinct from GtV isolates from Turkey and the Balkan countries. No geographic pattern was observed in phylogenetic subgrouping of CCHFV within South Russia. Identical isolates could be found at distant locations spaced by hundreds of kilometers, while relatively divergent viruses circulated in the same region. Full genome analysis indicated that reassortment events within GtVa occurred every few decades (median half-life of a non-reassortant node 30–40 years) and involved M and S segments. Therefore, in South Russia CCHFV represents a highly dynamic population of frequently reassorting viruses.
Читать
тезис
|
|
Phylodynamics of Crimean Congo hemorrhagic fever virus in South Russia
|
|
Девяткин Андрей Андреевич
Лукашев Александр Николаевич
|
Infection, Genetics and Evolution |
|
|
Филодинамика крымского конго генотипа V вируса геморрагической лихорадки (CCHFV) на юге России была проанализирована с использованием 244 частичных (452-571 нт) последовательностей во всех трех геномных сегментах и 38 полных геномных последовательностей. Несмотря на увеличение числа последовательностей, русская линия европейского генотипа V (обычно называемая GtVa) отличалась от изолятов GtV из Турции и балканских стран. В филогенетической подгруппе CCHFV на юге России географического паттерна не наблюдалось. Идентичные изоляты могут быть обнаружены в отдаленных местах, разнесенных на сотни километров, тогда как в том же регионе циркулируют относительно разные вирусы. Полный анализ генома показал, что события реассортировки в GtVa происходили каждые несколько десятилетий (средний период полураспада нереассортантного узла 30-40 лет) и включали сегменты M и S. Следовательно,
Читать
тезис
Публикация |
|
Phylodynamics of Crimean Congo hemorrhagic fever virus in South Russia
|
|
Девяткин Андрей Андреевич (старший научный сотрудник, лаборатория молекулярной биохимии)
Лукашев Александр Николаевич (Директор)
|
Infection, Genetics and Evolution |
|
|
Филодинамика крымского конго генотипа V вируса геморрагической лихорадки (CCHFV) на юге России была проанализирована с использованием 244 частичных (452-571 нт) последовательностей во всех трех геномных сегментах и 38 полных геномных последовательностей. Несмотря на увеличение числа последовательностей, русская линия европейского генотипа V (обычно называемая GtVa) отличалась от изолятов GtV из Турции и балканских стран. В филогенетической подгруппе CCHFV на юге России географического паттерна не наблюдалось. Идентичные изоляты могут быть обнаружены в отдаленных местах, разнесенных на сотни километров, тогда как в том же регионе циркулируют относительно разные вирусы. Полный анализ генома показал, что события реассортировки в GtVa происходили каждые несколько десятилетий (средний период полураспада нереассортантного узла 30-40 лет) и включали сегменты M и S. Следовательно,
Читать
тезис
Публикация |
